מנגד החליט משרד התחבורה לפגוע בשירות הרכבת לציבור הרחב בשבוע הבא, ויפקיע חלקים ממנו לטובת נוסעים חרדים שמגיעים להילולה במירון. ביום חמישי, ה-15 למאי, לא יופעל הקו מבאר שבע למרכז דרך להבים, קריית גת, מזכרת בתיה, רמלה ולוד בין השעות 9 בבוקר ל-14:00 בצהרים, ורכבות יופנו להסעת הבאים להילולה. הקו המקביל מהמרכז לבאר שבע דרך יישובי עוטף עזה ימשיך לפעול, אך יהיה עמוס מהרגיל, ולא יוכל לספק שירות ישיר לתחנות הקו המזרחי. סיעה דרך קו הנגב המערבי גם ארוכה יותר ב-28 דקות.
בנוסף ב-15-16 במאי יוכלו נוסעי רכבת לנסוע עד תחנת כרמיאל רק אם בידם כרטיס להילולה. אחרת אם יורדנו מהרכבת בתחנת אחיהוד ויאלצו להמשיך בשאטלים שיעמיד לרשותם משרד התחבורה. יצוין כי למרות שכבר פירסם אודות סידורי הנסיעה לציבור החרדי, נמנע משרד התחבורה מליידע את שאר נוסעי הרכבת על השינויים שיפגעו בהם.
