לפי דיווחים ערביים, 36 בתי-חולים ומרכזים רפואיים ברצועת עזה הותקפו במהלך המלחמה, בין אם בגלל תקיפות מהאוויר או אפילו לאור פעילות של כוחות צה"ל בתוך בתי-החולים עצמם. חלק מבתי-החולים ומרכזים רפואיים אלו יצאו מכלל שימוש – בעוד בחלקם חזרו להעניק שירותים רפואיים באופן חלקי לאחר שנפגעו. ארגוני הטרור ברצועת עזה מנצלים גם את בתי-החולים לטובת קידום פעילויות טרור ולכן ישראל נאלצת לפעול גם במקומות אלו, למרות הביקורת הבין-לאומית כנגדה בעניין.
צה"ל פעל ותקף גורמי טרור בכמעט כל בתי-החולים והמרכזים הרפואיים ברצועה, אך אלו העיקריים שבהם: בית-החולים שיפא, אשר נמצא בחלק המערבי של העיר עזה שבצפון הרצועה. צה"ל ביצע שתי פעולות משמעותיות בתוך בית-החולים הזה במהלך המלחמה: בנובמבר 2023 ובמרץ 2024 – כאשר פעולות אלו התמקדו בחיסול ומעצר של מחבלים שהסתתרו בבית-חולים זה, בחשיפת תשתיות טרור במקום ואף בחיפוש אחר חטופים שנטען כי הוסתרו בבית-החולים שיפא. לטענת העזתים, בעקבות פעילויות אלו של צה"ל בתוך שיפא – נהרסו מחלקות רבות, נגרם נזק לציוד רב ואף דיווחו על מאות הרוגים בשתי פעילויות אלו. כעת מדווחים ברצועה על כך שבית-החולים שיפא פועל בתקופה זו רק לקבלה של מקרים דחופים.
אתמול לפנות בוקר דיווחו ברצועת עזה על תקיפות של חיל-האוויר לעבר מבנה במתחם בית-החולים "אל-מַעְמָדאני", שתרגומו מערבית הוא הבפטיסטי וממוקם בעיר עזה שבצפון הרצועה. התקיפות לעבר מבנה זה בבית-החולים הבפטיסטי, שגם מכונה אצל העזתים כ"אל-אַהְלי אל-עַרָבּי" – הגיעה לאחר שצה"ל העביר הודעה לפינוי החולים והמטופלים בבית-חולים זה. בית-חולים זה עלה כבר לכותרת בימיה הראשונים של המלחמה, ב-17 באוקטובר 2023, לאחר שברצועה טענו כי חיל-האוויר תקף במקום ללא התראה וגרם למותם של עשרות הרוגים – כאשר די מהר דובר צה"ל הוציא הבהרה ובה הוכיח כי שיגור כושל של ארגון הטרור הג'יהאד האיסלאמי הוא זה שפגע בבית-החולים.
