מוחמד סינוואר היה גורם בולט בזרוע הצבאית של חמאס וממתכנני טבח 7 באוקטובר. לאחר חיסולו של מפקד הזרוע הצבאית של חמאס, מוחמד דף, ביולי 24' ומאחר וכמעט כל הצמרת הבכירה של הזרוע הצבאית של חמאס חוסלה – הוא הפך לאחראי בפועל על הזרוע הצבאית של חמאס, כשהמשמעות היא שהוא אחראי על הלחימה של חמאס ברצועת עזה.
מוחמד סינוואר היה בין האחראים לחטיפתו של גלעד שליט בשנת 2006, כאשר בעסקה בה שוחרר שליט – שוחרר מהכלא אחיו, יחיא סינוואר. בשל אחריותו לחטיפה של שליט ומאחר ועמד מאחורי פיגועים רבים שהוציאה לפועל הזרוע הצבאית של חמאס עוד לפני חטיפת שליט – הוא היה מבוקש שנים רבות על ידי ישראל ולכן היו ניסיונות לחסלו בסבבי הלחימה השונים, אך ללא הצלחה.
עוד קודם לכן, בראשית שנות ה-90', אחיו הקטן של יחיא סינוואר נעצר על ידי ישראל מאחר והכווין פעולות טרור נגד ישראל – כשבשל כך הוא נכנס לכלא לתשעה חודשים. עם השנים הוא היה לחבר במועצת המטכ"ל הצבאית בזרוע הצבאית של חמאס, כשבשנת 2005 הוא מונה להיות מפקד חטיבת ח'אן-יונס בארגון.